生态餐厅的主体结构是由多种形式的，连栋温室建设，所以生态餐厅建设时对主体结构的选择空间也很大。

  生态餐厅的结构形式多样，结合餐饮规模的特点可以在结构上采用不同形式，可以采用标准的轻钢结构连栋文洛式温室结构，也可以采用大型钢架结构（例如：大跨度H型钢结构、大跨度管桁架结构等等）或文洛式与大型钢架结构结合式，根据用户的需求不同，其外观也可以采用造型温室，将生态餐厅与周围环境整合为一个整体。目前生态餐厅建设采用的覆盖材料主要有PC阳光板、玻璃。一些生态餐厅屋面如果设计为半采光屋顶，温室建设造价，则可以将保温彩钢板和PC阳光板或玻璃间隔搭配使用，减少采光量。